"Тредстоун" повествует о секретной операции ЦРУ, которая должна пробудить в агентах по всему миру особый скрипт, заставляющий их начать миссию. Благодаря хитроумному программированию и проведению многочисленных тренингов спящие агенты получили невероятные силы и стали сверхлюдьми. Среди них оказывается и главный герой Борн. Пробуждение ознаменовало начало смертоносной миссии, мотивы и задачи которой ещё совершенно неясны. Главные персонажи, сами того не понимая, оказываются в центре внимания настоящего безумия, которое может привести к непоправимым последствиям. Что же будет дальше?